Xdscc12: Difference between revisions

Jump to navigation Jump to search

Xdscc12 (view source)

Revision as of 11:20, 13 April 2022

14,034 bytes added ,  13 April 2022
→‎Example output with explanation
Line 43: Line 43:


== Example output with explanation ==
== Example output with explanation ==
xdscc12 KD 2020-12-9. Academic use only; no redistribution. -h option shows options.
Please cite Assmann, G., Brehm, W., Diederichs, K. (2016) J.Appl.Cryst. 49, 1021-1028
  running 'xdscc12 temp.ahkl' on 20220413 at 12:13:53 +0200
  no option -w found, therefore statistics are weighted by sigma values
  no option -z found, therefore delta-CC1/2 values are Fisher-transformed
 
  reflection file is temp.ahkl
!SPACE_GROUP_NUMBER=   19
!UNIT_CELL_CONSTANTS=     38.30     79.10     79.10  90.000  90.000  90.000
  # of datasets=          20
  # obs (w/o misfits), unique, misfits =       51918       20213           0
  max and min resolution of data in file =   39.55000       1.801329   
  data between   39.55000      and   1.801329     A will be used
  10 resolution shells (for lines starting with b,c,e,f,r,s):
  5.644  4.011  3.281  2.844  2.545  2.324  2.152  2.013  1.899  1.801
 
  overall CC1/2:    83.328 nref=   14986 (but the overall CC1/2 is meaningless!)
  <CC1/2>:    44.468 (frequency-weighted average of CC1/2 in resolution shells)
  CC1/2 in resolution shells:
   91.4   81.0   72.0   68.4   42.1   41.4   32.4   29.0   33.2   28.2
  CC* in resolution shells:
   97.7   94.6   91.5   90.1   77.0   76.5   70.0   67.0   70.6   66.3
  frequency, i.e. number of unique reflections in resolution shells:
    493    887   1134   1345   1501   1649   1808   1921   2061   2187
 
  headings for lines starting with a,b,c:
a:  <CC1/2> of each dataset:
a:   reflections of this dataset only      reflections of all datasets
a: set   nref    with without   delta     nref    with without   delta
b: delta-CC1/2 in resolution shells
c: # reflections for delta-CC1/2
a      1   1241  61.936  42.634  26.227    14470  44.075  42.523   1.910
b 61.432 27.680 8.094 2.942 41.231 44.296 26.090 10.996 30.482 30.456
c     47     73     85    110    135    137    146    170    164    174
a      2   1565  43.941  34.156  11.512    14350  44.978  44.104   1.091
b 36.910 -5.982 -1.113 58.592 46.243 -24.157 -.234 20.068 11.307 -3.709
c     49     90    126    134    158    168    196    203    216    225
a      3   1754  39.551  29.634  11.233    14478  43.683  42.374   1.606
b 13.559 11.752 17.587 17.093 16.730 19.779 3.638 20.348 6.182 4.113
c     43    107    131    160    175    198    218    230    246    246
a      4   1468  41.694  25.840  17.768    14382  44.801  43.256   1.917
b -9.445 36.760 36.335 15.954 2.951 20.264 21.375 19.554 2.513 35.809
c     30     93     99    115    164    174    202    220    188    183
a      5   1412  41.785  39.193   3.100    14292  45.561  45.291   0.340
b 21.421 1.775 7.645 1.361 6.005 22.513 11.859 -16.883 .973 -2.353
c     41     68     82    111    144    173    176    190    210    217
a      6   1363  49.626  42.827   8.634    14293  44.938  44.354   0.728
b 32.175 53.390 25.822 21.623 -42.441 27.299 7.214 12.080 6.573 15.115
c     43     84     99    120    147    161    173    183    166    187
a      7   1686  48.062  37.817  12.521    14407  43.991  42.971   1.258
b 11.830 -4.851 11.505 15.574 67.688 20.009 5.129 -7.014 8.766 1.024
c     59    117    133    153    142    179    183    243    252    225
a      8   1795  46.357  34.049  14.614    14433  44.757  43.282   1.829
b 14.234 6.729 13.626 19.758 7.065 16.373 21.204 11.431 18.082 15.739
c     57    103    137    183    168    202    205    240    237    263
a      9   1483  50.778  46.558   5.526    14363  44.923  44.479   0.554
b 40.845 .431 30.046 -7.049 -1.607 -2.724 -9.486 -.902 20.019 27.538
c     46     88    119    135    154    161    193    192    203    192
a     10   1332  38.220  34.823   3.918    14506  43.988  43.550   0.541
b 33.078 34.752 9.425 25.010 -2.922 -14.118 14.600 12.844 1.512 -8.735
c     51     77     93    118    123    154    166    172    181    197
a     11   1477  45.163  38.543   8.015    14361  45.415  44.577   1.051
b 9.914 8.880 2.467 18.150 5.381 11.874 4.743 29.698 14.834 -17.211
c     65     82    111    133    115    159    174    202    220    216
a     12   1654  45.251  30.457  17.159    14409  44.363  42.437   2.373
b 28.681 6.430 -40.284 36.914 30.008 47.293 29.607 9.512 -1.455 21.488
c     53    109    116    142    154    177    196    229    235    243
a     13   1422  51.281  36.632  18.036    14302  44.261  42.742   1.872
b 23.460 4.559 43.871 13.497 28.091 35.298 -1.493 17.764 17.226 19.655
c     38     73    101    123    153    153    169    192    224    196
a     14   1668  51.749  49.607   2.882    14441  44.642  44.527   0.145
b 5.096 37.325 5.515 16.257 21.437 -7.901 14.955 4.960 -15.485 -2.206
c     52    115    121    161    172    177    201    205    223    241
a     15   1369  46.667  38.742   9.674    14263  44.480  43.770   0.882
b -22.140 29.901 48.902 -7.002 26.620 .483 8.071 13.097 11.535 -5.181
c     56     92    105    115    116    138    151    177    196    223
a     16   1257  33.100  23.275  10.645    14291  44.849  43.826   1.273
b -14.293 -.418 44.139 -1.828 30.203 21.053 5.098 22.834 -4.129 -.948
c     34     60     57    120    133    127    159    188    199    180
a     17   1370  42.421  39.259   3.794    14264  44.877  44.550   0.409
b 30.851 -17.854 11.508 12.578 -18.416 2.277 20.934 12.146 -.761 .881
c     33     72    106    131    134    151    157    189    197    200
a     18   1269  45.248  26.342  21.465    14302  43.295  41.438   2.264
b 23.189 2.571 31.364 37.883 60.830 25.784 13.345 33.459 -3.441 5.251
c     45    101     97    111    127    143    144    164    168    169
a     19   1644  43.200  43.114   0.105    14365  45.169  45.113   0.071
b 23.714 13.389 29.752 38.784 -16.069 6.952 10.177 9.560 -19.196 -16.013
c     56     87    132    138    168    179    183    215    236    250
a     20   1615  54.027  42.202  15.317    14366  45.818  44.496   1.661
b 20.068 20.724 30.458 21.475 33.352 28.157 5.646 16.916 9.398 8.795
c     52     87    131    149    156    181    195    200    230    234
  -------------------------------------------------------------
 
overall CC1/2ano:   -25.548 nref=    2668 (but the overall value is meaningless!)
<CC1/2ano> :   -21.370 (frequency-weighted average of CC1/2ano in resolution shells)
CC1/2ano in resolution shells:
  -75.0   -1.7  -30.1  -41.3  -38.8  -20.1  -18.2   -8.6  -17.7   -9.6
frequency i.e. number of unique Friedel pairs:
     73    140    168    241    262    320    319    351    397    397
 
  headings for lines starting with d,e,f:
d: <CC1/2ano> of each dataset:
d: reflections of this dataset only      reflections of all datasets
d: set   nref    with without   delta     nref    with without   delta
e: delta-CC1/2ano in resolution shells
f: # reflections for delta-CC1/2ano
d     1    190 -30.590 -20.348 -10.922     2233 -17.969 -17.817  -0.157
e -42.962 -6.341 4.502 -41.515 -76.721 -36.825 43.947 19.535 21.803 -23.853
f     11     12      9     14     17     28     26     22     26     25
d     2    234 -16.480 -16.515   0.036     2336 -26.125 -26.132   0.008
e -3.116 -2.078 -3.249 -23.820 6.424 9.198 -3.791 1.123 6.966 -4.309
f      5     12     16     12     35     30     40     24     29     31
d     3    343 -40.435 -31.820  -9.887     2245 -22.659 -19.640  -3.160
e -1.713 12.234 -11.942 -63.179 5.125 -4.423 15.291 -30.082 .859 3.714
f      7     16     27     33     42     45     38     54     43     38
d     4    250 -32.340 -29.274  -3.387     2385 -19.104 -18.426  -0.702
e 22.408 37.540 12.328 -13.456 -2.729 1.911 -36.173 3.026 -6.757 12.916
f      3     13     12     25     39     42     41     30     23     22
d     5    179 -22.995 -24.947   2.070     2417 -26.768 -27.230   0.499
e 36.142 13.527 -10.456 -7.251 13.331 -.923 27.239 -4.208 -9.635 -10.625
f      5      4      7      6     19     22     29     30     23     34
d     6    188 -10.090 -13.603   3.562     2412 -21.564 -21.759   0.205
e -43.278 1.987 48.529 -2.536 35.294 -14.994 21.066 -6.607 -.446 -8.161
f      5      9      8     10     21     28     25     30     27     25
d     7    292 -34.206 -35.887   1.915     2316 -26.435 -26.723   0.309
e -19.814 34.972 .715 48.559 -11.683 -4.391 -14.145 5.337 -3.722 2.527
f     12     15     16     23     31     43     28     46     45     33
d     8    305  -6.575  -7.745   1.176     2353 -19.132 -19.241   0.113
e -7.804 -5.876 -10.001 4.878 -37.785 8.976 14.698 -4.716 9.080 11.786
f     11     17     17     26     28     45     34     38     42     47
d     9    283 -35.313 -32.348  -3.347     2398 -20.019 -19.463  -0.578
e -90.495 31.505 6.592 -45.999 -7.955 -11.621 6.013 -6.399 18.725 2.816
f      7     16     14     23     31     32     39     37     52     32
d    10    228 -31.230 -36.231   5.639     2184 -20.991 -21.921   0.975
e -10.975 26.119 -31.629 9.944 10.170 24.916 -19.125 25.874 -12.123 -.504
f      6     23     12     16     17     32     31     33     27     31
d    11    204 -25.646 -21.039  -4.870     2344 -26.292 -25.997  -0.317
e 8.152 1.052 -8.483 4.821 5.281 -.012 -33.636 6.064 -12.304 -7.890
f     13     11     16     14     19     25     24     28     26     28
d    12    314 -20.795 -27.734   7.363     2299 -21.005 -22.984   2.080
e -53.587 19.115 79.436 41.903 -3.288 4.497 22.135 12.845 -21.183 -1.646
f      4     15     16     27     34     37     34     46     54     47
d    13    233  -6.551  -6.622   0.071     2411 -21.747 -22.084   0.354
e 7.268 -17.245 31.471 30.207 .209 7.647 5.126 -61.071 16.081 14.792
f      4     11     15     20     20     34     38     34     27     30
d    14    321 -39.745 -43.950   5.095     2335 -21.004 -21.556   0.578
e 6.661 20.182 -13.578 -14.964 .663 20.951 -5.357 11.106 6.979 4.542
f     13     26     24     29     37     30     31     33     48     50
d    15    211 -25.574 -27.428   1.993     2451 -21.107 -22.106   1.049
e 9.034 24.046 51.709 10.903 25.126 -31.105 -39.654 -43.178 6.990 15.268
f      9     18     23     17     21     28     15     22     28     30
d    16    164 -28.372 -24.930  -3.704     2381 -18.839 -18.689  -0.156
e 20.336 23.610 -96.956 -10.020 7.356 1.404 14.821 -20.025 -4.886 -17.264
f      2      6      2      9     17     20     33     24     20     31
d    17    218 -13.441  -3.184 -10.302     2460 -20.794 -19.807  -1.029
e -13.966 -12.793 5.985 10.830 -5.428 -23.834 17.910 -9.981 -25.620 -22.550
f      2     13     11     19     16     22     26     38     34     37
d    18    136 -32.513 -31.586  -1.034     2379 -21.312 -21.014  -0.312
e 55.859 17.851 -8.273 -57.797 -68.191 27.216 15.219 15.258 -14.424 -10.376
f      4     14     12     16     14     19     18     13     16     10
d    19    295 -26.211 -37.786  12.848     2289 -19.913 -21.583   1.745
e -3.719 -15.248 39.777 -13.377 11.415 8.559 -15.482 8.791 25.058 49.701
f      8     13     17     33     30     35     40     38     38     43
d    20    309 -33.133 -33.400   0.300     2351 -21.683 -22.124   0.463
e -30.012 13.423 -2.376 15.330 -16.239 -2.850 -9.170 5.549 10.005 1.910
f      9      9     15     32     33     36     40     48     48     39
 
  best delta-CC1/2_only=   26.22747   
  median of delta-cc1/2 ("only" i.e. 6th col of "a" lines) =   10.93907   
  noise= (MAD, median absolute deviation) from this median =   5.816339   
  median of delta-cc1/2 ("all" i.e. 10th col of "a" lines) =   1.174427   
  noise= (MAD, median absolute deviation) from this median =  0.6438574   
  median of delta-cc1/2-ano ("only" i.e. 6th col of "d" lines) =  0.1854570   
  noise= (MAD, median absolute deviation) from this median =   3.552712   
  median of delta-cc1/2-ano ("all" i.e. 10th col of "d" lines) =  0.1588948   
  noise= (MAD, median absolute deviation) from this median =  0.4448406   
 
Wrote a commented XSCALE.INP.rename_me that is sorted on delta-CC1/2 "only"
You may edit that file, or e.g. add lines after each INPUT_FILE line with sed '/INPUT_FILE/a INCLUDE_RESOLUTION_RANGE=99 3'
normal termination


== Correlation against a reference data set (-r <reference> option) ==
== Correlation against a reference data set (-r <reference> option) ==
Kay
Bureaucrats
2,684

edits

Retrieved from "https://wiki.uni-konstanz.de/xds/index.php/Special:MobileDiff/4396"
Cookies help us deliver our services. By using our services, you agree to our use of cookies.
More information

Navigation menu